Наследственные заболевания
Плавательный пузырь
У недавно вылупившаяся малька рыбы плавательный пузырь должен быть прозрачным. Мальки с расширенным плавательным пузырем плавают с открытой пастью. У больных рыб появляетмя искривление позвоночника и затруднение в дыхании. Из-за искаженной формы тела мальки страдают от ограниченных движений и от нехватки пищи. Болезнь возникает либо в результате механического или наследственного повреждения икринок. Болезнь неизлечима, и рыбы умирают, прежде чем они достигнут зрелости.
Физические пороки развития
Физические пороки развития включают врожденные дефекты, такие как отсутствие плавников, двойственность хвоста, изогнутый позвоночник и т. д. Возникает при скрещивании родственных особей. Болезнь также может возникнуть из-за механического повреждения икры. Болезнь неизлечима и мальки погибают.
Наследственное бесплодие или стерильность
Межвидовое скрещивания видов, полученные путем искусственного скрещивания, часто лишено фертильности из-за аномального развития половых клеток. В случае постоянного разведения потомство между близкими родственниками или между потомством слишком старой или слишком молодой рыбы также могут оставаться бесплодными.
Наследственная предрасположенность к паразитарным и экологическим заболеваниям
Некоторые видоы рыб не обладают иммунитетом к определенному заболеванию и заболевают почти сразу после того, как они сопрекоснулись с заболеванием (неоновая болезнь у харациновых, внешние паразиты у золотых рыбок). В большинстве случаев иммунитет рыб также связан с окружающей средой. Рыбы, которые долгое время выращивались в одной и той же среде, приобретают иммунитет к бактериям и паразитам в воде. У рыб в новой среде обитания нет иммунитета к паразитам и бактериям. В подходящей среде организм рыбы будет развивать иммунную систему против паразитов и бактерий. Более слабая рыба часто болеет и умирает при транспортировке на новое место.